Berani beriman Katolik dalam dunia Abad ke-21 semakin membawa tantangan. Dalam buku ini penulis mengangkat beberapa dari tantangan-tantangan itu. Ia bertolak dari suatu pertanyaan mendasar: Bagaimana Gereja Katolik yang berpegang pada Yesus Kristus sebagai satu-satunya penyelamat dapat sekaligus menegaskan bahwa keselamatan juga ditawarkan kepada orang-orang yang tidak dibaptis? Atas dasar keyakinan bahwa iman berakar dalam hati nurani kemudian dibahas dialog antar agama, sikap kita sebagai umat Katolik terhadap agama lain, khususnya agama Islam, implikasi etika politik Katolik bagi Gereja di Indonesia, kepemimpinan khas Kristiani serta hak kritik dalam Gereja.
Dalam bagian akhir buku ini penulis membahas tantangan terhadap agama dari pihak ilmu alam: Darwinisme, kosmologi fisikawan termahsyur Steven Hawking yang menyatakan bahwa Pencipta tidak diperlukan lagi, "ateisme baru“ Richard Dawkings serta buku Dan Brown The da Vinci Code yang beberapa tahun lalu membingungkan banyak umat Kristiani. Buku ditutup dengan renungan tentang bom-bom Natal.