Buku menggugat Tuhan merupakan catatan reflektif, kritis, dan perspektif atas praktek hidup beragama dalam masyarakat kita, berhadapan dengan tradisi atau kebiasaan-kebiasaan sosio-kultural yang sudah lama berlaku. Walaupun konteks kisah peziarahan iman si penulis dan praktek hidup beragama yang dibicarakan sebagian besar mengenai agama Katolik dan kebiasaan-kebiasaan hidup di Jawa, namun permasalahan yang diangkat di dalamnya sesungguhnya mempunyai arti yang jauh lebih luas.
Buku ini memang bukan merupakan telaah teologis, tetapi lebih merupakan suatu tuturan pengalaman pribadi seorang Jawa Katolik. Karena ia mau serius, ia banyak bertanya dan berusaha menghayati imannya secara bebas dan personal dalam konteks sosial, budaya, dan sejarah bangsanya.